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C、实施例的列举问题
这是专利制度对申请人的要求，申请人有必要通过实施例来证明所申请的基因专利具有实用性。我国目前在基因序列方面虽然还没有自主的知识产权，但从我国大量的基因专利申请的实践看，申请人都遵循了通过列举实施例证明实用性的规则。如国家人类基因组南方研究中心关于“一种新的人氧化还原酶蛋白及其编码序列”的专利申请就列举了“人HUCPA-OR基因的克隆”等7个实施例。但实施例和权利要求书中的权利要求并不等同。实施例的列举仅起到证明作用，权利要求必须在权利要求书中明确表达，当然，实施例所描述的功能或应用可以成为权利要求的对象。
5、基因专利申请对策
A、结构与功能
从结构与功能角度而言，通过测序往往发现大量基因的结构，但功能发现却是不易的。国家人类基因组南方研究中心找到500多个序列，但通过分析功能和评估，提出专利申请的只有100多件。但专利制度的“优先权”却使得发现基因新序列并非一无所用，基因新序列是申请专利的起点，国内外基因专利跑马圈地运动所申请的很多基因最初往往只是序列，但实用性的要求已经提高，必须利用优先权期限进行功能开发，适时的补充实验数据，满足实用性要求。从某种意义上而言，基因专利核心是基因功能，但这不等于说这是基因功能专利，因为如前文所述，基因专利是基于特定功能的基因序列等的专利。
在结构和功能方面，应明确三点：第一、发现新序列比发现基因功能更重要；第二、获得基因专利的前提条件不是要发现基因的全部功能，甚至不是要发现基因的重要功能。但至少要发现新基因的一个功能，重要功能或次要功能在申请中并不重要，当然，功能可能影响其商业价值。第三、发现已知基因的功能，仍可获得专利保护。
B、对策
对于申请人而言，基因专利申请要善于利用以下两点：
第一、尽早申请。找到新基因后就申请专利。以防止别人找到相同基因并发表因而丧失新颖性；
第二、利用优先权。充分利用一年的优先权期限进行功能和用途的研究，以克服实用性方面的缺陷。
C、实例
复旦大学遗传学研究所某位教授的溶菌酶申请案：
1998年提交中国申请，作为优先权基础；
1999年提出PCT 申请，（要求中国作为优先权并补充功能方面的实验数据）
2000年收到国际初审报告，（具有新颖性、实用性、创造性）
2001年PCT 申请进入中国、美国、欧洲、日本等国家。
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