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| 国家档案局 | 91 | 政府部门或单位与外国团体和组织签订含有利用档案内容的协定备案 | 《国务院办公厅关于保留部分非行政许可审批项目的通知》（国办发〔2004〕62号） |
| 92 | 中央专业主管部门成立档案馆审批 | 《国务院办公厅关于保留部分非行政许可审批项目的通知》（国办发〔2004〕62号） |
| 国家粮食局 | 93 | 陈化粮购买资格认定 | 《粮食流通管理条例》（国务院令第407号） |
| 94 | 陈化粮销售计划审批 | 《国务院办公厅关于保留部分非行政许可审批项目的通知》（国办发〔2004〕62号） |
| 国防科工局 | 95 | 军工电子产品出口立项审批 | 《国务院对确需保留的行政审批项目设定行政许可的决定》（国务院令第412号） |
| 96 | 军工电子装备科研生产许可 | 《国务院对确需保留的行政审批项目设定行政许可的决定》（国务院令第412号） |
| 国家烟草局 | 97 | 烟草专用机械大修理许可证核发 | 《国务院对确需保留的行政审批项目设定行政许可的决定》（国务院令第412号） |
| 98 | 烟草系统企业多元化经营投资项目审批 | 《国务院办公厅关于保留部分非行政许可审批项目的通知》（国办发〔2004〕62号） |
| 国家海洋局 | 99 | 海洋工程污染物排放种类核定 | 《防治海洋工程建设项目污染损害海洋环境管理条例》（国务院令第475号） |
| 100 | 海洋工程污染物排放数量核定 | 《防治海洋工程建设项目污染损害海洋环境管理条例》（国务院令第475号） |
| 中国民航局 | 101 | 民用机场专用设备使用许可 | 《国务院对确需保留的行政审批项目设定行政许可的决定》（国务院令第412号） |
| 国家邮政局 | 102 | 邮政企业及其分支机构的设置审批 | 《中华人民共和国邮政法实施细则》（国务院令第65号） |
| 国家文物局 | 103 | 拍摄易损的一般文物审批 | 《国务院对确需保留的行政审批项目设定行政许可的决定》（国务院令第412号） |
| 104 | 拓印内容涉及我国疆域、外交、民族关系的古代石刻审批 | 《国务院关于第三批取消和调整行政审批项目的决定》（国发〔2004〕16号） |
| 国家食品药品监管局 | 105 | 药品招标代理机构资格认定 | 《国务院办公厅转发国务院体改办等部门关于城镇医药卫生体制改革指导意见的通知》（国办发〔2000〕16号） |
| 国家中医药局 | 106 | 医疗机构开展医疗气功活动审批和从事医疗气功人员资格认定 | 《国务院对确需保留的行政审批项目设定行政许可的决定》（国务院令第412号） |
| 国家外汇局 | 107 | 出口单位出口收汇差额核销、核销备查核准 | 《国务院对确需保留的行政审批项目设定行政许可的决定》（国务院令第412号） |
| 108 | 企业租赁期不满一年、租赁贸易、租赁（照章征税）购付汇核准 | 《国务院对确需保留的行政审批项目设定行政许可的决定》（国务院令第412号） |
| 109 | 出口单位收汇分类核销核准 | 《国务院对确需保留的行政审批项目设定行政许可的决定》（国务院令第412号） |
| 110 | 金融机构大额结汇、售汇交易入市安排审批 | 《国务院对确需保留的行政审批项目设定行政许可的决定》（国务院令第412号） |
| 111 | 出口单位补办出口收汇核销专用联和出口收汇核销单退税专用联审批 | 《国务院对确需保留的行政审批项目设定行政许可的决定》（国务院令第412号） |
| 112 | 出口单位远期出口收汇备案 | 《国务院办公厅关于保留部分非行政许可审批项目的通知》（国办发〔2004〕62号） |
| 113 | 外商投资企业或中资企业适用跨国公司非贸易售付汇管理政策审核 | 《国务院对确需保留的行政审批项目设定行政许可的决定》（国务院令第412号） |
