(三)关于直属机构问题
省、市(地)国税局、地税局依照《方案》进行改革中，要严格控制直属机构设置；因工作需要确需增设内设机构的，要严格按规定权限报批；改革方案中必须明确机构设置职责及人员编制配置意见。
依据《方案》明确的对于大型企业(含大型涉外企业)、跨国公司，可以上收到市地税务局或者省(自治区、直辖市)税务局内设的征收机构和管理机构集中征收和管理。按财政预算级次和纳税人性质设立的直属分局必须撤销的要求，试点单位撤销现有涉外税收管理分局(处、科)及其他直属分局；省、地局设置内设的国际税务管理处(科)，负责税收协定执行、反避税、情报交换、我国及外国居民跨国收益税收监管等国际税务事项管理及现行涉外税收政策实施；地市局或者省局，设置负责大型企业(含大型涉外企业)、跨国企业税收管理的内设管理科(处)；大型企业(含大型涉外企业)、跨国企业税款由内设征收机构集中征收。对上收到市地税务局或省(自治区、直辖市)税务局管理和征收的大型企业(含大型涉外企业)、跨国企业，由总局规定范围，由各省(自治区、直辖市)税务局制定具体标准报总局核准并据此确定。
试点单位现有进出口税收管理分局改设为内设的进出口税收管理科(处)。
(四)关于各级国税局内设机构问题
根据国税发[2000]162号和178号文件精神，省国税局内设处室为8至10个(包括纪检监察和机关党委)，副省级市国税局的内设机构不超过9个，市国税局内设机构为6至8个；县(市)、区国税局内设机构不超过5个，上述规定均应严格执行。推行《方案》的试点单位，根据征管改革的需要，可以在上述两个文件规定的基础上增加2至3个内设机构，不得突破；特大城市的区局内设机构数确因工作需要须超过上述规定的，需报总局单独审批。
各级国税局内设机构的级别要和同级政府工作部门内设机构相一致。
各级地税局内设机构数和级别，应遵照本省有关部门的规定。
(五)关于撤销城区税务分局和税务所问题
各试点单位根据各地具体情况和实际征管需要，对于撤销城区税务分局和税务所问题，应慎重研究。凡撤销机构的，其人员及工作职责的归属必须在三定方案中明确，避免征管职能不到位，加剧疏于管理，淡化责任等情况的发生。
三、审批办法
各省国税局上报的试点方案，要包括：1．指导思想，2．实施步骤，3．新设、撤销、合并机构的原因，4．职能调整与界定，5．编制的界定及撤销机构后的人员安排去向。以上内容比照机构改革中各单位的三定方案的形式撰写，并附试点改革前后机构对比示意图等内容，经省局党组讨论后报总局。
