(二)产权界定。地方各级财政部门要会同经贸、税务、供销社等有关部门在清产核资的基础上，对棉花企业进行产权界定。除国家法律、法规另有规定外，棉花企业产权界定工作原则上按照国家经贸委、
财政部、税务总局《关于印发＜城镇集体所有制企业、单位清产核资产权界定暂行办法＞的通知》(国经贸企[1996]895号)的有关规定执行。
(三)企业改革。各省(自治区、直辖市)经贸部门要会同供销社等部门，按照区别对待、分类指导的原则，根据以下指导性意见，结合本地棉花企业的实际情况，提出棉花企业改革的具体意见，报同级人民政府批准后组织实施。
1．净资产规模较大，资产质量较好，符合棉花购销、加工条件的棉花企业，应建立现代企业制度。鼓励棉花企业通过相互参股，吸引社会法人和自然人入股，或是向社会法人和自然人转让股权，实现投资主体多元化。
2．净资产较少，资产质量一般，符合棉花购销、加工条件的棉花企业，应通过改组、兼并、联合、出售等形式放开搞活。涉及企业兼并的，兼并企业要承担被兼并棉花企业的全部债权、债务和职工安置工作；涉及企业出售的，出售所得应优先偿还所欠银行债务和安置企业职工。
3．资不抵债，连年亏损，扭亏无望，不能按期偿还债务的棉花企业，应依法实施破产。破产财产按有关法律规定的清偿顺序进行清偿。破产企业要妥善安置好职工，对安置职工费用不足的部分，由同级供销社出资弥补，供销社无力承担的部分，由企业所在地人民政府负担。
4．经营亏损，职工较少，债权、债务明晰的棉花企业，可关闭或依法破产。债务人与债权人对债务问题的处理达成一致意见，又能安置好职工的企业，可由供销社依法注销；对不能清偿债务，又不能达成协议的，可依法破产。
棉花企业改革中的有关税收问题，按照税务总局《
关于印发＜企业财产损失税前扣除管理办法＞的通知》(国税发[1997]190号)、《关于印发＜企业改组改制中若干所得税业务问题的暂行规定＞的通知》(国税发[1998]97号)和《关于企业合并分立业务有关所得税问题的通知》(国税发[2000]119号)等有关规定执行。
积极推进棉花企业产业化经营。要打破地区、行业、部门界限，以市场为导向，通过改组、改造、联合、兼并等形式，建立棉花生产、收购、加工、贸易一体化的贸工农企业集团。同时，加大棉花企业布局调整和技术改造力度，淘汰落后和过剩的生产能力。
(四)社企分开。棉花企业改革后，供销社各级联社即与棉花企业实现社企分开。
