会议着重讨论了卫生工作实行重点转移必须坚持的指导思想。一致认为，进行医药卫生现代化建设，一定要坚持四项基本原则，从我国的特点出发，走我国自己发展的道路。同时，我们只能在国民经济发展的现时水平上，从大抓整顿入手，来着手进行医药卫生现代化建设。我们要普遍整顿，全面提高，重点建设，边整顿边前进。具体的做法应该是：
第一、充实改造。对现有基础较好的医疗、卫生、科研、教育单位， 要在现有的基础上，加强管理，加强队伍的技术建设，改造和充实技术设备，逐步提高现代化水平；
第二、新建。用比较现代化的技术设备，建立少数医疗、卫生、科研中心，起示范和吸取经验的作用；
第三、大量的是因陋就简，充分发挥中西医药卫生人员的作用，提高技术水平，
加强管理，改善服务态度，解决广大群众的防病治病问题。
要贯彻自力更生、坚苦奋斗的精神。过去，我们依靠这种精神，推翻了三座大山，建立了新中国；现在，也要依靠这种精神进行四个现代化建设。为了实现医药卫生现代化，当然要引进一些必要的先进技术和装备，但主要依靠我们自己大搞技术革新和技术革命，发展我国医药工业，把生产搞上去，技术水平的提高也主要是依靠我们自己努力学习，刻苦钻研。大家认为，现代化不是等来的，也不是要来的，更不是买来的。而是靠我们自力更生，艰苦奋斗干出来的。各医药卫生单位都要加强经济管理，挖掘潜力，厉行节约，减少浪费，反对贪污盗窃行为。
我们一定要搞好安定团结。各级领导班子要搞好团结，医药卫生人员之间也要搞好团结。我们要加强政治思想工作，加强组织纪律性，对于无政府主义，对于各种不安定团结的因素，要积极采取办法加以解决。我们还要进一步解放思想，批判林彪、“四人帮”极左路线在卫生工作方面的影响，打破各种“禁”区，分清路线是非。对于历次政治运动中的遗留问题和“文化大革命”中的冤案、假案、错案，要在各级党委的领导下，本着实事求是、有错必纠的原则，继续抓紧进行平反和改正，把一切积极因素调动起来，同心同德搞四化。
二、关于医药卫生现代化建设的实际步骤和当前的任务
进行医药卫生现代化建设，究竟抓什么？与会同志一致认为，第一、要抓紧培养掌握现代科学技术的人才，没有这种人才 ，即使有了现代医药技术设备 ，也不能很好掌握使用，现代化也是一句空话。第二、我们要引进必要的先进技术和设备，但主要的是依靠自己的力量搞技术革命和技术革新，研制生产出相应的现代化技术设备，装备自己。第三、医药卫生机构要进行管理改革，实行科学管理。
为了达到这个目标 ，我们的实际步骤 ，就是要在今后三年内，贯彻调整、改革、整顿、提高的方针，抓好卫生战线的普遍整顿，使各级医药卫生单位的工作都达到或超过历史最好水平。会议提出的一九七九年的具体任务是：
