１、所属公司和其他经营实体应独立核算，依法经营，自负盈亏，照章纳税。其使用主管单位的房屋、设备、动力、资金、人力等，应按规定上交使用费、管理费，主管单位应冲减相应的事业费支出，余额部分为纯收入。其他上交收入全部作纯收入。
２、科学基金项目成果推广取得经济效益后，受资助单位上交的收入为纯收入。
（五）技术入股、联营分得的（税后）利润为纯收入。
（六）其他收入
１、机关按规定组织的其他各类社会服务收入，参照国管局有关文件的规定，计算成本和纯收入；
２、科技咨询、技术服务、技术培训、科技展览、科技交流等活动的收入，参照技术市场有关规定，扣除实际发生的成本（费用）后的余额，作为纯收入。
（七）评审、评估等申报项目评审费
１、收取的科学基金申请项目的评审费，按规定发放评审费和劳务酬金后，其余全部冲减评审业务支出。
２、接受委托评议、评估的奖励项目和实验室评估等申报项目评审费收入，扣除按规定发放的评审费及劳务酬金后，全部冲减其评审、评估业务费支出。
第五条 建立专用基金
（一）为促进科学基金事业的发展，稳定科学基金管理队伍，调动积极性，按第四条规定计算的纯收入，在扣除委托存款利息纯收入的６０％（直接转入事业发展基金）后的余额，按４∶３∶３比例建立事业发展基金、集体福利基金和奖励基金。
１、事业发展基金。用作补充科学基金；科技成果转化、科技开发投资；基金建设自筹资金；成果转化风险后备金。
２、职工集体福利基金。用于委内职工集体事业支出；职工医疗费补贴，职工子女医疗统筹补贴；工会活动费补助，食堂，托儿所补贴；委主任特殊备用基金等。
３、职工奖励基金，用于委内职工奖金发放、岗位津贴、表彰奖励支出等。
（二）上述基金中用于自筹基建支出时须经财政部审查资金来源后，由主管部门按规定程序报批立项。
第六条 凡经国家特批减免的税款，应单独计算，并全部直接转入事业发展基金，不得用于职工福利和职工奖励。
第七条 附则
（一）本办法适用于科学基金委员会组织的各项收入；
（二）有关有偿资助成果转化和开发投资及所属独立核算机构的财务管理，由科学基金委员会根据本办法，制订相应的管理办法和实施细则，并报财政部、国家科委审定。
（三）本办法自公布之日起实行。
