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除了清扫、冲刷、洗擦、日晒、焚烧、堆积发酵等物理消毒和生物学消毒方法以外，化学消毒应用最广泛。
几种常用消毒药品及其使用方法。
（1）石灰水：用新鲜石灰配成的10％～20％的石灰水，可用来消毒场地，粉刷棚圈墙壁、桩柱等。石灰水的配制方法：1千克生石灰加4千克～9千克水。先将生石灰放在桶内，加少量水使其溶解，然后加足水量。石灰水现配现用，放置时间过长会失效。
（2）草木灰水：适用于对棚圈、用具和器械等消毒。草木灰水配制方法：在10千克水中加2千克～3千克新鲜草木灰，加热煮沸（将草木灰水加热后使用才有显著的消毒效果，或用热水浸泡3昼夜），待草木灰水澄清后使用。
（3）烧碱：2％烧碱溶液可用来消毒棚圈、场地、用具和车辆等。3％～5％的烧碱溶液，可消毒被炭疽芽孢污染的地面。消毒棚圈时，将家畜赶（牵）出栏圈，经半天时间，将消毒过的饲槽、水槽、水泥地或木板地用水冲洗后，再让家畜进圈。
（4）过氧乙酸：2％～5％的过氧乙酸溶液，可喷雾消毒棚圈、场地、墙壁、用具、车船、粪便等。
（5）复合酚：复合酚100倍～300倍液适用于喷雾消毒畜舍、场地，浸渍污物等。
（6）百毒杀：用百毒杀3000倍稀释液喷洒、冲洗、浸渍，可用来消毒畜舍、环境、机械、器具、种蛋等。百毒杀2000倍液可用于紧急预防畜禽舍的消毒。百毒杀10000倍～20000倍稀释液可预防储水塔、饮水器被污物堵塞，可以杀死微生物和除藻、除臭、改善水质。
由市畜牧兽医系统统一组织调拨各地新大卫1号、大卫立康消毒粉、大卫立洁、大卫宝碘、菌毒杀、菌毒净等消毒药品，按说明书要求配制后对环境、器械等进行消毒。
（五）灾区动物饲养
一要做好畜禽舍环境的清扫工作；二要对所有圈舍进行全面消毒；三要对未进行口蹄疫、猪瘟、鸡新城疫和高致病性蓝耳病免疫接种的畜禽，立即进行免疫接种，对已进行免疫接种的畜禽，根据免疫抗体检测情况及周边疫情情况，必要时强化免疫一次，根据疫情动态，做好预防接种工作；四要防止畜禽霉菌饲料中毒。霉菌饲料中毒没有有效治疗方法，重在预防，严禁饲喂腐败、变质或霉变的饲料。注意饲料的保质期，防止食用过期饲料。
（六）灾后恢复生产
目前由于灾区种猪种禽普遍不足，灾后农民急需补栏，可能需要到外地调运，稍有不慎，就会带进疫病，引起疫病的流行和传播。灾后补栏需要及时防疫，注意避免从疫区引进种畜禽，并加强动物卫生检疫监管工作。
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