3、生产组织方式的标准化程度不高。农产品生产仍以千家万户、分散型的生产方式为主，规模小、集约化程度低、科技含量不高，难以实现标准化生产和品牌化经营，同时也给农业投入品的管理带来了很大难度。这种生产方式给农产品质量提高，特别是给在农业生产投入品使用上实行有效和全面的监管带来了一定的困难。
4、技术支撑与信息化管理水平较为薄弱。由于目前农产品生产的组织化程度较低，农业科技水平不高，因而，有关安全农产品的各项生产技术规程和产品质量标准难以完全贯彻到位；大多数无公害农产品分级加工、包装和实施标志管理的程度还很低，农产品质量的信息化溯源还不能真正付诸实施，整体信息管理运用水平偏低。
5、食品加工环节监管措施不够到位。食品加工企业规模普遍较小，食品安全监管难度较大，10人以下企业达90%以上，使得对食品实物质量的监督检验受到限制，监管力度受到制约。突出表现在：一是加强监管与法律法规不健全的矛盾；二是监管工作量大和监管人力资源不足的矛盾。
6、农贸市场管理服务工作亟待提高。农贸市场改造、新建工作和绿色市场建设工作取得了显著成果，农贸市场硬件设施条件有了较大幅度的提升，但是软件管理水平仍显落后，管理方式落后、服务意识淡薄、信息化管理水平不高，农产品可追溯能力较低。
7、菜篮子工作经费不足。我市扶持菜篮子工程的工作经费与青岛、杭州、武汉等国内其他兄弟城市相比，存在一定的差距，制约了菜篮子工程工作的顺利开展，不利于我市食品安全形势的持续好转，应引起足够的重视。
三、指导思想与发展目标
（一）指导思想
以科学发展观为指导，坚持以人为本，以确保城乡居民菜篮子食品安全消费为核心，以法规政策体系、标准化体系、检验检测体系、产地准出和市场准入体系建设为重点，以三绿工程为抓手，以观念创新、机制创新、科技创新和手段方法创新为动力，以政策引导、资金扶持为保障，全面实现农产品质量安全“从田头到餐桌”的全程质量控制，努力使我市“菜篮子放心工程”工作处于全国领先地位。
（二）总体目标
至2012年末，全市菜篮子食品生产、加工、经营秩序进一步规范，供给能力大幅提高，市场流通更加有序，严格控制食品安全事故和案件的发生，人民群众食品消费的安全感明显增强。食品安全法律法规体系、监管体系、标准化体系、检验检测体系、储备保障体系、信用体系基本健全，科学有效，行业协会作用得到充分发挥，企业食品安全意识进一步增强，人民群众日益增长的食品质量安全和健康需求不断得到满足。
（三）具体目标
1、生产基地建设目标
--增加蔬菜生产基地建设，提高全市蔬菜产品的自给能力，力争常年性叶菜自给率达到90%以上。至2012年，全市高标准设施蔬菜面积达7万亩，占常年性蔬菜面积的35%；有机蔬菜生产基地达到2万亩；以水芹和莲藕为主的水生蔬菜基地达到5万亩；鼓励六合超大蔬菜基地、栖霞八卦洲野生蔬菜基地的发展。
--加强标准化规模养殖基地建设。进一步加强牧业技术推广力度，持续推进标准化规模养殖基地建设，切实提高畜产品市场供应能力。规划期间内新建或完善200头规模的奶牛公寓27家、47个标准化生猪规模养殖基地（场）、10个规模蛋鸡场、5个百万只优质家禽养殖基地（小区）、10个畜禽良种场（基地），全市规模养猪比重达到55%，蛋禽达到70%，肉禽达到80%，奶牛达到95%。力争肉类自给率达30%以上，蛋类自给率达25%以上，奶类自给率达70%以上。
--切实加强经济区域内的分工与合作，努力探索产区和销区互动共赢的新机制。积极与巢湖、滁州及淮安等周边产区的副食品生产基地建立合作互惠机制，发挥销区的市场作用，充分吸收产区的剩余生产能力，引导菜篮子商品生产、流通渠道的外部化，实现产销区共赢局面。
2、市场体系建设目标
--加快信息化平台和物流配送中心建设，全力推进南京农副产品物流配送中心和南京现代粮食物流中心项目，加强新建住宅小区农副产品配套网点的建设，完善我市农副产品物流配送体系。
--深入开展绿色市场创建工作，积极推进“农加超”经营业态，加快农贸市场升级改造步伐和超市化进程，并以城区市场为重点，带动郊县市场发展。到本规划末，城区市级农副产品绿色市场数达到80%，区县农村绿色市场数达到30%，全市通过第三方认证注册的国家级绿色市场达到30%。
