第二十一条 建立审计重大问题处理整改机制，对跟踪审计中发现的重大违纪违规问题，审计机关应及时下达审计处理及整改意见，督促相关单位加强项目管理，有效防范风险，尽量节约投资，确保建设资金规范、高效、安全使用。
第二十二条 审计机关应建立完善跟踪审计项目台账，及时登记审计时间、审计事项、审计发现问题、审计意见和建议及被审计单位的整改落实情况，汇总审计成果。
第四章 审计程序
第二十三条 政府投资项目跟踪审计，应确定建设单位作为主要被审计单位，审计通知书只发送建设单位。同时在审计通知书中明确，实施审计中将对与建设项目相关的单位进行延伸审计或审计调查。延伸审计发现相关单位存在问题的，应当在审计职权范围内进行处理处罚或移送有关部门处理。
第二十四条 政府投资项目实施跟踪审计3日前，应当向被审计单位送达审计通知书。被审计单位应当根据审计通知书的要求及时提供与建设项目相关的资料，并对相关资料的真实性、完整性作出书面承诺，不得转移、隐匿、伪造或者毁弃，不得拒绝、阻碍审计人员依法执行公务。应及时提供相应的图纸、隐蔽工程记录、工程变更联系单等资料，并对真实性、完整性负责。
第二十五条 对需要审核的政府投资项目工程变更事项和对工程造价有重大影响事项，建设单位应在施工前及时告知审计机关，并提供相关资料。
第二十六条 审计机关针对跟踪审计中发现的问题，可以出具审计报告、跟踪审计建议函、跟踪审计情况通报等形式及时提出审计建议，督促建设单位进行整改；跟踪审计项目审计结束，应当依据法定程序出具审计报告。跨年度的跟踪审计项目可根据需要出具年度跟踪审计报告。
审计机关应当检查和监督被审计单位对跟踪审计建议函、审计报告和审计决定的采纳、整改及落实情况。
第二十七条 审计组根据政府投资项目进度和跟踪审计计划及实施情况，及时向审计机关提交审计报告。在提交审计机关审议前应书面征求被审计单位的意见，被审计单位应当自收到审计报告之日起10日内提出书面意见，逾期未提出的，视为无异议，并由审计人员予以注明。审计机关对审计组的审计报告进行审议后，提出审计机关的审计报告。
