（五）国库科
　　负责组织协调国家、自治区有关金库管理制度、政府总预算会计制度和国库集中支付制度在地区的贯彻执行，拟订地区有关制度和办法并贯彻执行；负责地区预算执行及分析预测；负责地区预算会计管理工作，负责联系并协调人民银行喀什地区中心支行有关工作；办理地区预算内外资金收支、核算划拨事项；审核汇总编制地区财政总决算、部门决算，负责地区财政资金调度工作；统一管理地区财政和地区级行政事业单位的银行开户的核准、备案事项，管理地区本级财政专户；负责国债的兑付、销毁管理以及国债市场的监管工作；提出财政资金收付管理制度改革的政策建议；管理地区财政统发工资工作等。
　　（六）行政政法科
　　承担行政、政法、外事、军队、武警等方面的部门预算有关工作，研究提出相关财政政策；根据地区实际，制定行政性经费财务管理办法，研究提出行政性经费开支标准和定额；落实部门（单位）和项目资金使用的财务管理办法；组织实施财政行政政法项目专项资金绩效考核工作；审批分管部门（单位）的年度财务决算；负责本级接待经费的监督管理工作。
　　（七）教科文科
　　承担教育、科技、文化等方面的部门预算有关工作，研究提出相关财政政策；根据国家事业单位通用财务制度和新闻、出版、电影行业的财务管理制度，拟订地区补充制度和办法；研究制定财政支持教科文事业改革与发展的政策建议，提出优化事业支出结构的建议；按规定管理教科文事业发展财政专项资金，拟订相关资金管理办法；组织实施财政教科文项目专项资金绩效考核工作；审批分管部门（单位）的年度财务决算。
　　（八）经济建设科
　　承担建设、国土、交通、环保、供销等方面的部门预算有关工作，研究提出相关财政政策；参与拟订地区建设投资的有关政策；拟订地区基本建设财务管理制度；审核批复财政投资项目竣工财务决算；承担有关政策性补贴和专项储备资金财政管理工作；组织实施财政经济建设项目专项资金绩效考核工作；制定部门（单位）和专项资金管理办法；审批分管部门（单位）年度财务决算。
　　（九）农业科
　　承担农业、林业、水利、农机、气象等方面的部门预算有关工作，研究提出相关财政政策；贯彻执行农口事业、企业财务管理制度，并拟订地区相关实施细则；制定地区财政支农资金管理办法，管理财政支农专项资金；管理政策性农业专项贷款贴息；组织实施财政农业项目专项资金的绩效评价工作；审核和批复相关部门（单位）的年度财务决算。

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